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榆林实时荧光定量pcr服务为先 南京英瀚斯

发布时间:2021-11-12 08:38:37        







DNA测序检测

1. PCR测序反应

(1)取0.2ml的PCR管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加***:

所加***测定模板管标准对照管

BigDye Mix

1μl

待测的质粒DNA

1μ 1

pGEM-3Zf (+)双链DNA

-1μ1

待测DNA的正向引物

M13(-21)引物- 1μ 1

灭菌去离子水

2μ 1

总反应体积5μ 1,不加轻矿物油或石蜡油,盖紧PCR管,用手指弹管混匀,稍离心。

(2)将PCR管置于9600或2400型PCR仪.上进行扩增。98C变性2min后进行PCR循环,

PCR循环参数为96C 10s, 50C 5s, 60°***min, 25 个循环,扩增结束后设置4C保温。

2.乙醇法纯化PCR产物

(1) 将混合物离心,将扩增产物转移到1.5ml EP管中。

(2)加入25μ 1/乙醇混合液,充分振荡,置冰上10min以沉淀DNA。12 000r/min于

4C离心30 min,小心弃上清。

(3)加70%(V/V)的乙醇50μ 1 洗涤沉淀2次。12 000r/min 于4C离心5min,小心弃上清和

管壁的液珠,真空干燥沉淀10~ 15min。

3.电泳前测序PCR产物的处理。

(1)加入12μ 1的TSR于离心管中,剧烈振荡,让其充分溶解DNA沉淀,稍离心。

(2)将溶液转移至盖体分离的0.2ml PCR管中,稍离心。

(3)在PCR仪上进行热变性(95C 2min),冰中骤冷,待_上机。

4..上机操作按仪器操作说明书安装毛细管,进行毛细管位置的校正,人工手动灌胶和建立

运行的测序顺序文件。

5.仪器将自动进行序列分析,并可根据用户要求进行序列比较。如测序序列已知,可通过

序列比较以星号标出差异碱基处,提高工作效率。

6.测序完毕按仪器操作规程进行仪器清洗与***。





蛋白质定量组学服务

细胞内蛋白质组丰度的动态变化对不同生命过程有重要影响。在65℃恒温水浴锅中水浴30min,也可转入37℃水浴12~24h,间歇振荡离心管数次。例如在许多***的发生和发展进程中,常常伴随着某些蛋白质的表达异常。目前定量蛋白质组学技术主要分为标记(label)策略和非标记的(label free)定量策略,其中标记策略又分为体内标记(如 SILAC、15N 标记),以及体外标记(如 iTRAQ、TMT 标记) 。

传统的基于2D双向凝胶电泳分离的蛋白质组通常可以鉴定出约1000种蛋白,对全蛋白质组的覆盖仅在5~10%左右,不能满足高通量定量蛋白质表达谱分析的要求。基于此,STR分析法已经成为一种重要的鉴定分析方法,应用于法***、qin子鉴定及细胞鉴定等领域。我们结合样品制备与高分辨率、高灵敏度的液相色谱-质谱联用技术,可在细胞与***类样品中鉴定直至多于10000个蛋白,对全蛋白质组的覆盖>60%。结合生物信息学分析,为您构建高通量蛋白质定量表达谱。








25.PCR扩增不出就引物有问题吗?

答:基本不是。结束反应,PCR产物放置于4°C待电泳检测或-20°C长期保存。当今发展出各色各样的PCR扩增技术,各色各样的高温聚合酶,就是来解决PCR扩增中遇到的扩不出、扩增效率低的问题。如巢式PCR就是扩增那些拷贝数很低的***片段。 有些重复片段的扩增, GC含量高的片段,非要采用特殊扩增手段才能扩增出了。

引物扩增不出,主要是下列两种情况比较常见:

(1) RT-PCR。请注意,很多***通过常规RT -PCR方法是很难扩增出来的。 RT- PCR成功的关键在于RT的反应的RNA质量和目标***在特定***和细胞中含量。

(2)从***组中扩增。一般情况下,***在***组中都是单拷贝,***组作为模板需要严格控制用量。***组DNA过高,会影响反应体系中的Mg和pH





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