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戴经理 先生
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发布时间:2021-11-14 03:41:52
DNA测序检测
1. PCR测序反应
(1)取0.2ml的PCR管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加***:
所加***测定模板管标准对照管
BigDye Mix
1μl
待测的质粒DNA
1μ 1
pGEM-3Zf (+)双链DNA
-1μ1
待测DNA的正向引物
M13(-21)引物- 1μ 1
灭菌去离子水
2μ 1
总反应体积5μ 1,不加轻矿物油或石蜡油,盖紧PCR管,用手指弹管混匀,稍离心。
(2)将PCR管置于9600或2400型PCR仪.上进行扩增。98C变性2min后进行PCR循环,
PCR循环参数为96C 10s, 50C 5s, 60°***min, 25 个循环,扩增结束后设置4C保温。
2.乙醇法纯化PCR产物
(1) 将混合物离心,将扩增产物转移到1.5ml EP管中。
(2)加入25μ 1/乙醇混合液,充分振荡,置冰上10min以沉淀DNA。12 000r/min于
4C离心30 min,小心弃上清。
(3)加70%(V/V)的乙醇50μ 1 洗涤沉淀2次。12 000r/min 于4C离心5min,小心弃上清和
管壁的液珠,真空干燥沉淀10~ 15min。
3.电泳前测序PCR产物的处理。
(1)加入12μ 1的TSR于离心管中,剧烈振荡,让其充分溶解DNA沉淀,稍离心。
(2)将溶液转移至盖体分离的0.2ml PCR管中,稍离心。
(3)在PCR仪上进行热变性(95C 2min),冰中骤冷,待_上机。
4..上机操作按仪器操作说明书安装毛细管,进行毛细管位置的校正,人工手动灌胶和建立
运行的测序顺序文件。
5.仪器将自动进行序列分析,并可根据用户要求进行序列比较。如测序序列已知,可通过
序列比较以星号标出差异碱基处,提高工作效率。
6.测序完毕按仪器操作规程进行仪器清洗与***。
腺相关病毒包装原理
腺相关病毒( adeno-associated virus, A***)是一类细小病毒, 基铟组为单链DNA ,对分裂细胞和非分裂细胞均具有gan染能力。通常需要腺病毒或疱zhen病毒帮助其在体内fu制扩增。重组腺相关病毒( recombinant A***, rA*** )是利用A***2型***组与不同xue清型的衣壳蛋白***组结合产生的混合体病毒载体,可将目的***的CDS区序列或者RNAi干扰序列插入rA***表达质粒中,包装病毒后gan染细胞完成对目的***的操作。腺相关病毒具有gan染温和,免yi原性小,长效稳定表达的特点,主要应用于动物体内***。源井生物提供的腺相关病毒颗粒经过超su离心纯化,并通过qPCR对病毒***拷贝进行滴定。腺相关病毒的滴度在10^12~10^13GC/ml ,可以满足各类整体实验的使用要求。凝胶扫描及图像分析(1)图像扫描:凝胶染色后采用Imagescanner以300dpi,16-bit模式(65536灰阶)进行扫描。
RNA提取及注意事项
研究***的表达和调控时,需要从***或细胞中分离纯化RNA。RNA质量的高低经常影响RT-PCR、cDNA库构建和Northern Blot等分子生物学实验的成败。
主要***
Trizol是一种新型总RNA抽提***,内含异***胍等物质,能迅速破碎细胞,***细胞释放出的核酸酶。
1.
Trizol***含有,具***性和刺激性,注重操作。
2.
RNase污染的主要来源是操作过程中手和空气中的浮沉,注重配带手套,样品尽可能盖严。
3. 细胞裂解必需充分且操作迅速。裂解不完全会降低后得率,因为一部分RNA会残留在未裂解的细胞中。细胞裂解之后要看不见颗粒状物质(结缔***和骨除外)。在清洗和裂解细胞时在低温下操作,防止在操作过程中释放的内源RNase降解了RNA。
4. 酵母和一些***由于细胞壁的特别结构,可以加入Trizol***同时加入无RNase的玻璃珠并剧烈振荡,使细胞裂解充分。
2-8℃ 避光保存一年。
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