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发布时间:2021-12-09 01:43:14
分子实验介绍——印迹(Western blot)检测
通过SDS-PAGE凝胶将细胞或生物样品内的蛋白按照蛋白分子量从大到小规律分离开。经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如纤维素薄膜或PVDF膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的起反应,再与酶或同位素标记的第二起反应(目前主要用HRP标记的第二),经过底物显色或自显影以检测电泳分离的特异性目的***表达的蛋白成分(目前主要使用鲁米诺和二抗中的HRP反应发出荧光,通过仪器或者胶片显色)。该技术广泛应用于检测蛋白水平的表达。采用结合微阵列技术在染色体***表达调控区域检查染色体活性,是深入分析***l症、心血l管病以及******系统紊乱等***主要通路的一-种非常有效的工具。
实验流程:细胞收集-细胞裂解,蛋白提取-蛋白变性-SDS-PAGE电泳-蛋白质转膜印记-蛋白封闭-目的孵育-二抗孵育-显色拍照
结果示例:
图 A不同大小的质粒转染细胞后,Western blot检测图片;B A蛋白不同培养时间后Western blot检测图片;C 使用Image pro plus软件对A蛋白灰度检测,A蛋白表达变化统计图
逆转录病毒构建及包装
逆转录病毒(Retrovirus)是一类RNA病毒。在逆转录酶的作用下,以病毒RNA为模板合成cDNA再通过DNA、转录、翻译等过程形成病毒颗粒。逆转录病毒表达系统是一种新的重组蛋白表达系统,由逆转录病毒载体、辅助载体(表达病毒包装需要的蛋白质)和包装细胞系组成。逆转录病毒载体在外源***表达、***沉默、、生物制药等得到广泛的应用。其基础是在强电场下不同分子的由于其所带电荷,大小,结构以及疏水性等不同而相互分开。逆转录病毒载体主要优点:转染范围广,可以各种细胞类型,转入的外源***可完全融合,对细胞率高,细胞不产生病变,可建立细胞系长期持续表达外源***。
逆转录病毒载体系统共有两部分组成:包装细胞系和缺陷病毒本身。在逆转录病毒载体中,去除了正常的蛋白编码序列而保留了和包装信号,通过分子技术将目的***插入此载体上,而包装细胞系能提供病毒载体包装成病毒粒子所需的结构蛋白。当重组病毒载体导入包装细胞后,缺陷病毒载体和包装细胞的互补作用共同完成病毒装配,该病毒颗粒可其它宿主细胞,此时目的***进入该细胞并整合到细胞***组中,导致插入序列在宿主细胞中表达,产生目的蛋白。宿主细胞不能像包装细胞那样为缺失结构***的逆转录病毒提供结构蛋白,因而在宿主细胞内不会产生新的毒颗粒,保证了该载体在生物制品领域的生物安全性问题。上机操作按仪器操作说明书安装毛细管,进行毛细管位置的校正,人工手动灌胶和建立运行的测序顺序文件。
单细胞测序(英语:Single cell sequencing)采取优化的下一代DNA测序技术(NGS)检测单细胞的序列,可以获得特定微环境下的细胞序列差异以方便研究其功能差异等。对个体细胞的DNA测序可以帮助我们了解例如在中的小范围细胞的变异;全转录组测序全转录组是指特定***或细胞在特定状态下所有转录产物的总和,包括mRNA和各种noncodingRNA。对其进行RNA测序可以帮助我们了解和鉴别不同的细胞类型与其表现的***,对研究发育生物学等有较大裨益。
分离单细胞
在全***组扩增和测序前,有很多方法可以分离细胞个体,其中流式细胞术(FACS)较为常用。个体细胞可以用显微操作来收集,这样较为快捷而且成本较低,但是比较有技术难度,而且显微镜下对细胞的错误分类容易影响实验结果。激光捕获显微切割技术(LCM)亦可以用来收集单细胞。但是尽管激光捕获显微切割可以保留样本细胞在***中的空间位置,但是捕获单细胞的时候容易连带周围细胞的物质。高通量的细胞个体分离还可以使用微流控技术。微流控技术和流式细胞技术都能准确而自动地分离无偏样本。用HIPCE方法处理DNA水解产物来确定5mC水平,简便,经济且敏***高。但是,两种方法都要求首先将细胞从其为环境中脱离,因此可能在RNA表达分析中造成对转录数据的干扰。
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