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发布时间:2022-04-13 21:31:11
STR检测
短串联重复(Short tandem repeats, STR),又称微wei星DNA(Microsatellite DNA)或简单重复序列(Simple repeat sequence, SRS或SSR),是广泛存在于原核生物和真核生物***组中的核苷酸重复序列。大部分线粒体***由于其母系遗传特性以及进化速率较快等特点,被广泛地用于种群遗传学、进化生物学、谱系地理学和系统发育学、***诊断等学科领域。有丝分裂过程中DNA链之间的错配引起的fu制滑动被认为是导致STR产生的较为常见原因,并且依据不同fu制单元大小的不同以及不同物种之间,fu制滑动发生的概率也不相同。
STR是以序列 (core repeat units) 首尾相连多次重复形成。技术流程:dsRNA或pre-miRNA被导入细胞后,能够被一种特异的核酸内切酶(Dicer)识别并切割成为小片段,这些片段在RNA解旋酶的作用下解链。每个STR的序列结构相同,长度为2-6bp,但其重复单位数目和重复区域的长度不同,因此STR在不同种族、不同人群之间的分布具有差异性,构成了STR遗传多态性。不同个体之间在一个同源STR位点的重复次数也不同,因而同***识别一样,STR位点分析也可对个体进行身份识别。通过识别个体***组在特***点的特定序列重复,即可创建其***档案。基于此,STR分析法已经成为一种重要的鉴定分析方法,应用于法***、qin子鉴定及细胞鉴定等领域。
蛋白质定量组学服务
细胞内蛋白质组丰度的动态变化对不同生命过程有重要影响。但是长期以来,大规模的蛋白质表达分析谱并没有提升我们对生物标志物的认识,其主要原因是差异蛋白的分析结果缺乏规模化的验证。例如在许多***的发生和发展进程中,常常伴随着某些蛋白质的表达异常。目前定量蛋白质组学技术主要分为标记(label)策略和非标记的(label free)定量策略,其中标记策略又分为体内标记(如 SILAC、15N 标记),以及体外标记(如 iTRAQ、TMT 标记) 。
传统的基于2D双向凝胶电泳分离的蛋白质组通常可以鉴定出约1000种蛋白,对全蛋白质组的覆盖仅在5~10%左右,不能满足高通量定量蛋白质表达谱分析的要求。2009年,外显子组捕获工具的出现,让外显子组测序这种技术迅速红起来。我们结合样品制备与高分辨率、高灵敏度的液相色谱-质谱联用技术,可在细胞与***类样品中鉴定直至多于10000个蛋白,对全蛋白质组的覆盖>60%。结合生物信息学分析,为您构建高通量蛋白质定量表达谱。
RNA pull down 检测
RNA pull down:RNA沉淀检测,是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的主要实验方法之一。基于此,STR分析法已经成为一种重要的鉴定分析方法,应用于法***、qin子鉴定及细胞鉴定等领域。使用体外转录将RNA进行生物素标记,并与细胞蛋白裂解液孵育,形成RNA-蛋白复合物。复合物通过磁珠结合后分离,复合物纯化洗脱后通过Western blot验证检测特性的蛋白。若筛选可能结合的蛋白通过质谱实验进行检测筛选。
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