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发布时间:2022-07-15 16:30:32
***组甲l基化水平(Methyl ati on Content)的分析:
1.高l效液相色谱(Hi gh-performanceLi qui dChromatography, HPLC)HPLC是- -种比较传统的方法,是根据DNA或蛋白分子量和构象的不同而使其加以分离。由于在动态相和静态相下分子的光吸收度并不相同而加以定量。结果示例:细胞荧光染通过观察细胞中蛋白的荧光强度和***分析该蛋白的表达变化。随着系统的压强的增加,其分辨率增l高。故而能够定量测定***组整体水平DNA甲l基化水平。该方法由Ruo等1980年首l次报道。过程是将DNA样品先经盐酸或氢l氟酸水解成碱基,水解产物通过色谱柱,结果与标准品比较,用紫外光测定吸收峰值及其量,计算5 mC/(5mC+5C)的积分面积就得到***组整体的甲l基化水平。这是一种检测DNA甲l基化水平的标准方法。
2.高l效毛细管电泳法(Hi gh-per formance Capillary Electrophoresis, HPCE)这是一-种利用窄孔熔融石英毛细管来从复合物中分离不同化学组分的技术。2、细胞转染:取两个EP管,一个加入Opti-MEM、核心质粒和包装质粒。其基础是在强电场下不同分子的由于其所带电荷,大小,结构以及疏水性等不同而相互分开。用HIPCE方法处理DNA水解产物来确定5mC水平,简便,经济且敏***高。
活性氧检测***盒(Reactive oxygen species assay kit)是一种利用荧光探针DCFH-DA进行活性氧检测的***盒。DCFH-DA本身没有荧光,可以自由穿过细胞膜,进入细胞内后,可以被细胞内的酯酶水解生成DCFH。结合在固相载体表面的抗原或抗ti仍保持其免yi学活性,酶标记的抗原或抗ti既保留其免yi学活性,又保留酶的活性。而DCFH不能通透细胞膜,从而使探针很容易被装载到细胞内。细胞内的活性氧可以氧化无荧光的DCFH生成有荧光的DCF。检测DCF的荧光就可以知道细胞内活性氧的水平。 本***盒提供了活性氧阳性对照***Rosup以便于活性氧的检测。Rosup是一种混合物(compound mixture),浓度为50mg/ml。
一、注意事项
1、探针装载后,一定要洗净残余的未进入细胞内的探针,否则会导致背景较高。
2、探针装载完毕并洗净残余探针后,可以进行激发波长的扫描和发射波长的扫描,以确认探针的装载情况是否良好。
3、尽量缩短探针装载后到测定所用的时间(刺激时间除外),以减少各种可能的误差。
4、为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
◆ HPLC
如果合成的寡核苷酸应用于,定向诱变或定量的***探测,那么对其纯度要求较高。脱盐或OPC纯化的寡核苷酸可能达不到要求,则HPLC纯化被广泛地用于这个目的。近年来,分子生物学检测技术的方法学研究取得了进展,先后建立了各种分子生物学检测技术。作为一种纯化树脂,阴离子交换树脂或反向树脂被用于寡核苷酸纯化。阴离子交换树脂的HPLC通常显示95-98%纯化效率,对于达到35-mer寡核苷酸的纯化是充分的。反向树脂化的HPLC与阴离子交换树脂的HPLC呈现相似的纯化效率。因为HPLC的纯化效率很大程度依靠寡核苷酸的长度,用HPLC法不能有效纯化长的寡核苷酸(大于35-mer)。
◆ PAGE
对于长的寡核苷酸的纯化(50-100mer),我们推荐PAGE纯化法,它使用交连的聚酰胺凝胶(电泳)作为纯化基质。而安捷伦和Illumina的探针能够在低密度下捕获更多数量的变异。尽管PAGE显示出高的纯化效率(>98%),但它在额外的步骤方面有一些缺陷,比如在PAGE之后需要提取和脱盐,继而将导致纯化产率的下降。
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